RESEARCH ASSISTANT ÖMER ORKUN    
Name : ÖMER
Surname : ORKUN
E-Mail : orkun@ankara.edu.tr, omerorkun@yahoo.com.tr
Phone Number : 0312 317 0315/ 4349
Title : RESEARCH ASSISTANT
Unit : FACULTY OF VETERINARY MEDICINE
Department : Department of Parasitology
Personal Information

PERSONAL and CONTACT INFORMATION

Ömer ORKUN, DVM, Ph.D., Assoc.Prof.  
E-mail: omerorkun@yahoo.com.trorkun@ankara.edu.tr 

Address: Ankara University, Veterinary Faculty, Department of Parasitology, Protozoology and Entomology Unit 06110 Altındağ ANKARA/TURKEY

Tel: +90 312 317 03 15/4349

Fax: +90 312 316 44 72


EDUCATION and WORKING

Undergraduate Education: 

Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine (DVM) (2006-2011) 

Postgraduate Education: 

Doctorate: Ankara University, Health Science Institute, Department of Parasitology (2011-2015) 

Ph.D. Thesis Title: “Some Ecological and Epidemiological Data Belonging to Tick Species in Ankara and Around”

Working:

Research assistant at Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Parasitology (2012-2015)

Dr. Research assistant at Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Parasitology (2015-2019)

Associate Professor at Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Parasitology

Research Areas: Ticks, Tick-borne diseases, Tick Ecology, Epidemiology, Entomology, Protozoology, Molecular Phylogenetic, Wildlife. 

Membership

Turkish Society for Parasitology

-COST (European Cooperation in Science and Technology):         

CA15116 Understanding and combating African Swine Fever in Europe- MC member (2016- )

- CA18208 Novel tools for test evaluation and disease prevalance estimation MC member (2019- )

 

Lectures Given

Entomology

Protozoology

Honey Bee Diseases

 

LIST of PUBLICATIONS

1.    Orkun Ö., Çakmak A., Nalbantoğlu, S., Karaer Z. Turkey tick news: A molecular investigation into the presence of tick-borne pathogens in host-seeking ticks in Anatolia; Initial evidence of putative vectors and pathogens, and footsteps of a secretly rising vector tick, Haemaphysalis parvaTicks and Tick-borne Diseases2020. doi.org/10.1016/j.ttbdis.2020.101373 (in press)

2. Orkun Ö. Molecular investigation of the natural transovarial transmission of tick-borne pathogens in Turkey. Veterinary Parasitology273: 97-104, 2019

3. Orkun Ö., Çakmak A., Nalbantoğlu S., Karaer Z. Molecular detection of a novel Babesia sp. and pathogenic spotted fever group rickettsiae in ticks collected from hedgehogs in Turkey: Haemaphysalis erinacei, a novel candidate vector for the genus BabesiaInfection, Genetics and Evolution69: 190-198, 2019.

4.    Orkun Ö., Çakmak A. Molecular identification of tick-borne bacteria in wild animals and their ticks in Central Anatolia, Turkey. Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases63: 58-65, 2019.

5. Orkun Ö. Molecular characterization based on 16S rDNA phylogeny of some ixodid ticks in Turkey. Turkiye Parasitol. Derg., 42: 122-129, 2018.

6.   Orkun Ö., Nalbantoğlu S. Hepatozoon canis in Turkish red foxes and their ticks. Veterinary Parasitology: Regional Studies and Reports13: 35-37, 2018.

7.     Orkun Ö., Karaer Z. First record of the tick Ixodes (Pholeoixodeskaiseri in Turkey. Experimental and Applied Acarology74: 201-205, 2018.

8.     Orkun Ö., Koç N., Sürsal N., Çakmak A., Nalbantoğlu S., Karaer Z. Molecular characterization of tick-borne blood protozoa in stray dogs from Central Anatolia Region of Turkey with a High-Rate Hepatozoon infection. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi24(2): 227-232, 2018

9.     Orkun Ö., Karaer Z. Molecular characterization of Babesia species in wild animals and their ticks in Turkey. Infection, Genetics and Evolution55: 8-13, 2017.

10.  Kuscu F., Orkun O., Ulu A., Kurtaran B., Komur S., Inal A.S., Erdogan D., Tasova Y., Aksu H.S.Z. Rickettsia sibirica mongolitimonae infection, Turkey, 2016. Emerging Infectious Diseases23(7): 1214-1216, 2017.

11.  Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in ticks in Turkey: A broad range tick surveillance study. Infection, Genetics and Evolution52: 59-66, 2017.

12.  Orkun Ö., Emir H., Karaer Z. Ticks threatening lineage of Anatolian wild sheep (Ovis gmelinii anatolica) and determination of their tick-borne pathogens. Veterinary Parasitology228: 77-84, 2016

13.  Celebi ARC., Orkun O. A rare case of tick infestation of the eyelid: case report and literature review. Revista Brasileria de Oftalmologia75 (2): 144-146, 2016

14.  Yahyaoğlu M., Karabay O., Gürcan Ş., Tuna N., Orkun Ö. Investigation of tularemia seroprevalence after tick bite. Online Türk Sağlık Bilimleri Dergisi1(2): 1-5, 2016.

15.  Demirel Kaya F., Orkun Ö., Çakmak A., Öcal M., İnkaya AÇ., Ergüven S. A Case of Extensive wound myiasis caused by Lucilia serricata (Diptera: Calliphoridae) in a patient with maxillary sinus squamous cell carcinoma, in Turkey. Journal of Arthropod-Borne Diseases10(2): 268-271, 2016.

16.  Koylu M. T., Gokce G., Uysal Y., Araz E., Orkun O., Cakmak A., Nalbantoglu S. Unexpected cause of conjunctival infection. Saudi Medical Journal36 (4): 502-503, 2015

17.  Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Identification of tick-borne pathogens in ticks feeding on humans in Turkey. PLoS Neglected Tropical Diseases8(8): e3067, 2014.

18.  Demirel Kaya F., Orkun Ö., Çakmak Ç., İnkaya A.Ç., Ergüven S. Cutaneous myiasis caused by Sarcophaga spp. in a diabetic patient. Mikrobiyol Bul48 (2): 356-361, 2014.

19.  Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Spotted fever group rickettsiae in ticks in Turkey. Ticks and Tick-borne Diseases5: 213-218, 2014.

20.  Orkun Ö., Guven E. A new species of Haemoproteus from a tortoise (Testudo graeca) in Turkey, with remarks on molecular phylogenetic and morphological analysis. The Journal of Parasitology99 (1): 112-117, 2013.

21.   Orkun Ö., Deniz A., Güven E. Survey of Theileria annulata and Theileria buffeli/orientalis complex in cattle in the Kırşehir region using multiplex-PCR. Turkiye Parasitol Derg36: 9-11, 2012.

22.  Güven E., Çakmak A., Orkun Ö., Akçay A., Koçak A. Prevalence of Babesia bigemina and Theileria annulata in Cattle in Eregli, Turkey. Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi1 (1): 18-21, 2012.

23.  Karaer Z., Orkun Ö., Sürsal N. Coccidiosis in cattle, sheep and goats. Turkiye Klinikleri J Vet Sci3(2): 1-8, 2012.

24.  Aştı C., Özbakış G., Azrug A. F., Orkun Ö., Nalbantoğlu S., Çakmak A., Burgu A. Results of calf stool examination of the different Provinces. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 18: 209-214, 2012.

25.  Karaer Z., Guven E., Nalbantoglu S., Kar S., Orkun O., Ekdal K., Kocak A., Akcay A. Ticks on humans in Ankara, Turkey. Experimental Applied Acarology54: 85-91, 2011.

26.  Güven E., Nalbantoğlu S., Orkun Ö., Akçay A., Koçak A. Prevalence of Eimeria species in Cattle in Mucur District of Kırşehir. Kafkas Univ Vet Fak Derg16 (3): 483-486, 2010.

Proceedings in National and International Conferences

1.     Orkun Ö. Preliminary results of the study investigating the presence of ASF virus in wild boars and their ticks in Turkey. Final international conference of the COST Action ASF-STOP- Understanding and Combating African Swine Fever in Europe, 29-30 January, Brescia/Italy, p. 26, 2020

2.     Orkun Ö., Emir H. Türkiye’de doğal olarak yaşayan çeşitli yabani hayvanlardan kan emen keneler ve bu kenelerdeki kene-kaynaklı patojenlerin identifikasyonu: Theileria capreoli, Hepatozoon ursi ve CandidatusRickettsia barbariae’nin Türkiye’deki ilk bildirimleri. 21. Parazitoloji Kongresi, 28 Eylül-3 Ekim, Çeşme, İzmir, p. 334-335, 2019.

3.     Orkun Ö., Çakmak A., Nalbantoğlu S., Karaer Z. Turkey tick news: preliminary results from a molecular investigation into the presence of tick-borne pathogens in host-seeking ticks in Anatolia. 13th International Symposium on Ticks and Tick-borne Diseases, 28-30 March, Weimar/Germany, p. 145-146, 2019

4.     Orkun Ö., Çakmak A., Nalbantoğlu S., Karaer Z. Molecular detection of a novel Babesia sp. and pathogenic SFG rickettsiae in ticks collected from hedgehogs in Turkey: Haemaphysalis erinacei, a novel candidate vector for genus Babesia. 14th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases, 6-9 November, Sitges/Spain, 2018

5.     Orkun Ö. Molecular investigation of the natural transovarial transmission of tick-borne pathogens in Turkey. XV International Congress of Acarology, 2-8 September, Antalya/Turkey, p. 61, 2018.

6.     Orkun Ö., Karaer Z. Türkiye’deki yabani hayvanlarda ve kenelerinde Babesia türlerinin moleküler karakterizasyonu: Yaban tavşanlarında yeni bir Babesia spp. genotipi varlığının kanıtı. 20. Ulusal Parazitoloji Kongresi (Uluslararası katılımlı), 25-29 Eylül, Eskişehir, p. 431-432, 2017

7.     Orkun Ö., Çakmak A. Türkiye’deki yabani hayvanlarda ve kenelerinde kene-kaynaklı bakteriyel patojenlerin identifikasyonu: Candidatus Rickettsia goldwasserii’nin ilk bildirimi. 20. Ulusal Parazitoloji Kongresi (Uluslararası katılımlı), 25-29 Eylül, Eskişehir, p. 367-368, 2017

8.     Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in ticks in Turkey: a broad range tick study. 27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), 22-25 April, Viyana/Avusturya, 2017.

9.     Sürsal N., Koç N., Orkun Ö., Çakmak A., Nalbantoğlu S, Karaer Z. Ankara İli Gölbaşı İlçesindeki Köpeklerde Neospora caninum'un Seroprevalansının Belirlenmesi. 19. Ulusal Parazitoloji Kongresi ve Uluslararası Katılımlı Ekinokokkozis Sempozyumu, 5-9 Ekim, Erzurum, p. 160-161, 2015

10.  Koç N., Sürsal N., Orkun Ö., Çakmak A., Nalbantoğlu S, Karaer Z. Ankara İli Gölbaşı İlçesindeki Barınak Köpeklerinde Babesia canis Seroprevalansının Belirlenmesi. 19. Ulusal Parazitoloji Kongresi ve Uluslararası Katılımlı Ekinokokkozis Sempozyumu, 5-9 Ekim, Erzurum, p. 160, 2015

11.  Orkun Ö., Emir H., Karaer Z. Anadolu Yaban Koyununun (Ovis gmelinii anatolica) Soyunu Tehdit Eden Keneler ve Kene Kaynaklı Hastalıklarının Tanımlanması ve Mücadelesi. 19. Ulusal Parazitoloji Kongresi ve Uluslararası Katılımlı Ekinokokkozis Sempozyumu, 5-9 Ekim, Erzurum, p. 71-72, 2015

12.  Orkun Ö., Karaer Z. Türkiye’deki Kene Türleri; Biyoloji ve Konak Tercihleri. 18. Ulusal Parazitoloji Kongresi, 29 Eylül-5 Ekim, Denizli, p. 124, 2013

13.  Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Ankara İli ve Çevresindeki Kızıl Şahinlerde (Buteo rufinusLeucocytozoon Türlerinin Morfolojik ve Moleküler Karakterizasyonu. 18. Ulusal Parazitoloji Kongresi, 29 Eylül-5 Ekim, Denizli, p. 147, 2013

14.  Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Ankara’daki İnsanlara Tutunan Kenelerde Babesia, Borrelia ve Rickettsia Türlerinin Moleküler Karakterizasyonu. 18. Ulusal Parazitoloji Kongresi, 29 Eylül-5 Ekim, Denizli, p. 127-128, 2013

15.  Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Nalbantoğlu S. Leucocytozoonosis in long-legged buzzards (Buteo rufinus), Turkey. International Conference on Malaria and Related Haemosporidian Parasites of Wildlife 7-11 Ağustos Vilnius, Litvanya, 2013

16.  Hekimoğlu O., Özer N., Orkun Ö., Karaer Z. Ankara ilinde yaygın bulunan kene türleri. 21. Ulusal Biyoloji Kongresi, 3-7 Eylül, İzmir, p. 867, 2012

17.  Orkun Ö., Güven E., Deniz A., Çakmak A., Karaer Z. Kırşehir Yöresi Sırlarında Theileria annulata ve Theileria orientalis/buffeli Varlığının Multiplex-PCR Yöntemiyle Saptanması. 17. Ulusal Parazitoloji Kongresi ve Kafkasya ve Ortadoğu Paraziter Hastalıklar Sempozyumu, 4-10 Eylül, Kars, p. 219-220, 2011

18.  Aştı C., Özbakış G., Azrug A.F., Orkun Ö., Nalbantoğlu S., Çakmak A., Burgu A. Değişik İllere ait Buzağı Dışkı Bakısı Sonuçları. 17. Ulusal Parazitoloji Kongresi ve Kafkasya ve Ortadoğu Paraziter Hastalıklar Sempozyumu, 4-10 Eylül, Kars, p. 189-190, 2011

19.  Güven E., Orkun Ö, Nalbantoğlu S., Çakmak A., Karaer Z. Pediculosis: a neglected problem in humans. Fourth International Conference on Phthiraptera 13-18 Haziran Ürgüp Kapadokya, Turkey, 2010

20.  Koçak A., Nalbantoğlu S., Güven E., Ekdal K., Orkun Ö., Karaer Z., Çakmak A., Ankara’da Evcil Hayvan Parkı ve Hayvanat Bahçesindeki Çeşitli Hayvanlarda Coccidia Türlerinin Araştırılması. 16. Ulusal Parazitoloji Kongresi, 1-7 Kasım, Adana, p.219, 2009

 

OCCUPATIONAL BOOKS and BOOK CHAPTERS

1. Eren H., Karagenç T., Orkun Ö. (2015). Rickettsiales. In: Dumanlı N., Karaer Z. (eds.). Veterinary Protozoology. Second Edition. Medisan: 80, Ankara, s. 241-252. ISBN 978-975-7774-79-2.

2. Karaer Z., Orkun Ö., Nalbantoğlu S. (2015). Introduction to Arthropodology. In: Karaer Z., Dumanlı N. (eds.). Arthropodology. Medisan: 81, Ankara, s. 1-24. ISBN 978-975-7774-80-8.

3. Karaer Z., Orkun Ö., Çiçek H. (2015). Crustacea. In: Karaer Z., Dumanlı N. (eds.). Arthropodology. Medisan: 81, Ankara, s. 303-308. ISBN 978-975-7774-80-8.

4. Çiçek H., Orkun Ö. (2016). 4. Parasitic Diseases of birds (chicken, turkey, duck and goose) 4.1. Protozoan diseases in the circulatory system of birds. Leucocytozoonosis In: Özcel M.A. (Coord.), Karaer Z. (ed.) Parasitic Diseases in Veterinary Medicine. Volume 1, Second Edition, Meta Publication, İzmir, s.512-515. ISBN 978-605-87556-1-1 (Tk), 978-605-87556-2-8 (1.c).

5. Çiçek H., Orkun Ö. (2016). 4. Parasitic Diseases of birds (chicken, turkey, duck and goose) 4.1. Protozoan diseases in the circulatory system of birds. Plasmodium Infections. In: Özcel M.A. (Coord.), Karaer Z. (ed.) Parasitic Diseases in Veterinary Medicine. Volume 1, Second Edition, Meta Publication, İzmir, s.516-519. ISBN 978-605-87556-1-1 (Tk), 978-605-87556-2-8 (1.c).

6. Çiçek H., Orkun Ö. (2016). 4. Parasitic Diseases of birds (chicken, turkey, duck and goose) 4.1. Protozoan diseases in the circulatory system of birds. Haemoproteus Infections. In: Özcel M.A. (Coord.), Karaer Z. (ed.) Parasitic Diseases in Veterinary Medicine. Volume 1, Second Edition, Meta Publication, İzmir, s.520-522. ISBN 978-605-87556-1-1 (Tk), 978-605-87556-2-8 (1.c).

7. Çiçek H., Orkun Ö. (2016). Parasitic Diseases of birds (chicken, turkey, duck and goose) 4.1. Protozoan diseases in the circulatory system of birds.  Aegyptianellosis. In: Özcel M.A. (Coord.), Karaer Z. (ed.) Parasitic Diseases in Veterinary Medicine. Volume 1, Second Edition, Meta Publication, İzmir, s.523-524. ISBN 978-605-87556-1-1 (Tk), 978-605-87556-2-8 (1.c).

 

SCIENTIFIC PROJECTS

1. Ticks species in Ankara and around; Molecular determination of the existence of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in ticks and determination of host relationship and seasonal activity of ticks.

Researcher; Ankara University, BAP (2014-2016)

2. Some ecological and epidemiological data belonging to tick species in Ankara and around.

Researcher; Ankara University, BAP (2014-2017)

3. Probiyotik kaynaklı ekzopolisakkaritlerin (EPS) kanatlı yemlerinde prebiyotik katkı olarak kullanılmasının araştırılması.

Researcher; TAGEM, (2015-2019)