ARŞ.GÖR. PINAR KOCABAŞ    
Adı : PINAR
Soyadı : KOCABAŞ
E-posta : pkocabas@ankara.edu.tr
Tel : 2033526
Ünvan : ARŞ.GÖR.
Birim : MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ
Bölüm : KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ
Kişisel Akademik Bilgiler

Lise (1998): İzmir Bornova Anadolu Lisesi

Lisans (2002): ODTÜ Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü 

Yüksek Lisans (2004): ODTÜ Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği ABD

Yüksek Lisans Konusu: Bacillus acidocaldarius’un aromatik amino asit üretim performansı

Yüksek Lisans Tez Danışmanı: Prof. Dr. Pınar ÇALIK, ODTÜ Kimya Mühendisliği Bölümü

Doktora (27.2.2017):  Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği ABD

Doktora Tez Danışmanı: Prof. Dr. H. Tunçer ÖZDAMAR, Ankara Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü


KARİYER VE İŞ TECRÜBESİ

2003-2004: Araştırma Görevlisi, ODTÜ Kimya Mühendisliği Bölümü 

2004-2005: Doktora Öğrencisi, UC Davis Kimya Mühendisliği Bölümü 

2006-2010:  TÜBİTAK-BİDEB Yurtiçi Doktora Bursiyeri

2010-Bugün: Araştırma Görevlisi, Ankara Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü, Proses ve Reaktör Tasarımı Anabilim Dalı 

 YAYINLAR

6. Kocabaş, P., Çalik, G., Çalik, P., Özdamar, T.H. 2017. Analyses of extracellular protein production in Bacillus subtilis- II: Responses of reaction network to oxygen transfer at transcriptional level. Biochemical Engineering Journal. 11 Temmuz 2017'de kabul edildi.

5. Kocabaş, P., Çalik, P., Çalik, G., Özdamar, T.H. 2017. Analyses of extracellular protein production in Bacillus subtilis- I: Genome-scale metabolic model reconstruction based on updated gene-enzyme-reaction data. Biochemical Engineering Journal. 11 Temmuz 2017'de kabul edildi.

4. Çalık, G., Kocabaş, P., Afşar, H., Çalık, P., Özdamar, T.H. 2016. Parametric continuous feed stream design to fine-tune fed-batch bioreactor performance:  Recombinant human growth hormone production in Bacillus subtilis. Journal of Chemical Technology & Biotechnology. 27 Kasım 2015’de kabul edildi.

3. Özdamar, T.H., Şentürk, B.,Yilmaz, Ö.D., Kocabaş, P., Çalik, G., Çalik, P. 2010. Bioreaction network flux analysis for human protein producing Bacillus subtilis based on genome-scale model. Chemical Engineering Science 65, 574–580.

2. Kocabaş, P., Çalik, P. , Çalik, G., Özdamar, T.H. 2009. Microarray studies in Bacillus subtilis. Biotechnology Journal 4, 1012–1027. 

1. Kocabaş, P., Çalık, P., Özdamar, T.H. 2006. Fermentation characteristics of l-tryptophan production by thermoacidophilic Bacillus acidocaldarius in a defined medium. Enzyme & Microbial Technology 39, 1077–1088.

 Uluslararası Tebliğler

a)      Sözlü sunuşlar

1) Kocabaş, P., Çalık, G., Özdamar, T.H. (2012). Metabolic Flux Analysis by Transcriptome-Data Supported Genome-Scale Model for Human Protein Producing Bacillus subtilis. 9th European Symposium on Biochemical Engineering Science (ESBES-9), İstanbul, Turkey. (Sunan: Pınar Kocabaş)

2) T.H. Özdamar, B. Şentürk, Ö.D. Yılmaz, P. Kocabaş, G. Çalık. Bioreaction network flux analysis for human protein producing Bacillus subtilis based on genome-scale model. 20th International Symposium on Chemical Reaction Engineering (ISCRE 20), Kyoto, 2008, Japan.                                    

b) Poster sunuş

3) Özdamar, T.H., Kocabaş, P., Yılmaz, Ö.D. and Çalık, G. (2012). Flux analysis by microarray supported genome-scale model for human protein producing Bacillus subtilis. 22nd International Symposium on Chemical Reaction Engineering (ISCRE 22), Maastricht, Netherlands. (Sunan: Pınar Kocabaş)

4)  Kocabaş, P., Çalık, P., Çalık, G. and Özdamar, T.H. (2014). Assessment of genome-scale and biochemical reaction based network models for protein production in Bacillus subtilis10th European Symposium on Biochemical Engineering Sciences and 6th International Forum on Industrial Bioprocesses (ESBES-IFIBIOP 2014)-Lille-France.(Sunan: Pınar Kocabaş)

Ulusal Tebliğ: Sözlü sunuş

5) Kocabaş, P., Çalık, G., Özdamar, T.H. (2012). Protein Üretiminde B.subtilis Hücreiçi Tepkimelerinin Reaksiyon Mühendisliği Prensipleriyle Analizi. 10. Ulusal Kimya Mühendisliği Kongresi (UKMK-10), İstanbul. (Sunan: Pınar Kocabaş)

6) Kocabaş, P., Çalık, P., Çalık, G., Özdamar, T.H. (2014). Terapatik Protein rhGH Üretiminde Oksijen Aktarımının Reaksiyon Hızlarına Etkisi. 11. Ulusal Kimya Mühendisliği Kongresi (UKMK-11), Eskişehir. (Sunan: Pınar Kocabaş)

7) Kocabaş, P., Çalık, P., Çalık, G., Özdamar, T.H. (2016). Oksijen aktarımının terapötik protein üretiminde hücreiçi tepkime hızlarına etkisinin reaksiyon mühendisliği prensipleriyle analizi. 12. Ulusal Kimya Mühendisliği Kongresi (UKMK-12), İzmir. (Sunan: Pınar Kocabaş)

Katıldığı Kurslar

Microalgae Process Design Course, 8-15 Temmuz 2016, WAGENINGEN, The Netherlands.

 ARAŞTIRMA ALANI        

Rekombinant biyomoleküllerin üretimi

Biyokimyasal reaksiyon mühendisliği prensipleriyle hücreiçi tepkime sistemlerinin genom seviyede modellenmesi ve analizi

Mikrodizin analizi

Metabolik mühendislik

Genom bilimi ve sistem biyolojisi

Termofilik mikroorganizmalar 

Yeşil kimya

 Araştırma Görevlisi olarak görevlendirildiği DERSLER

Uygulamalar: Bilgisayar Programlama (KYM 138), Fizikokimya (KYM 207), Numerical Methods (CHE 236), Kimya Mühendisliği Laboratuvarı I (KYM 351), Kimya Mühendisliği Laboratuvarı II (KYM 453), Kimya Mühendisliği Laboratuvarı III (KYM 454)

Lisans Dersler:  CHE 212 Fluid Dynamics, Thermodynamics, Mühendislik Ekonomisi (KYM 363), Kimyasal Reaksiyon Mühendisliği (KYM 306), Kimya Mühendisliği Matematiği, Proses Tasarımı I-II (KYM 415, KYM 416), Proses Kontrol.